二月六日，年節氣氛濃厚的小年夜，當家家戶戶正準備著過年時，凌晨三時五十七分熟睡之際，突來的天搖地動，震碎了台南的許多家庭。
財團法人中華民國日蓮正宗基金會除了於二月十一日，提撥三十萬元濟助台南市政府慰問救助，表達日蓮正宗僧俗的關懷之意。更於三月二十日上午十時，於南台分事務所秘要山法宣院，為地震中不幸罹難的亡者，奉修慰靈法會，祈念冥福。
當日，濕冷的天氣籠罩著南台灣，信徒們於九時三十分陸續抵達寺院。本興院石橋主管特地南下主持法會，本照院秋元主管，以及林講頭、許副講頭也專程參加。為罹難者舉辦的慰靈法會隆重肅穆，有二百七十餘位信徒參加，本堂內的精靈台前立著大塔婆，石橋主管先行拈香，接著帶領僧俗讀經、唱題，信徒一一為亡靈拈香回向，氣氛肅穆。
如儀奉修法會後，石橋主管表示，在三大秘法之御本尊的御寶前建立塔婆，以大御本尊廣大無邊的功德誠懇回向，將與會者的追善之意，透過御本尊傳達給罹難者。
主管強調，日蓮大聖人在『立正安國論』中一語道破，錯誤宗教招來世相的混亂，導致人心騷動，進而引發天災及人禍。當今是五濁充滿的惡世末法時代，大聖人為救濟在苦惱中的一切眾生，建立了大御本尊。希望以今日法會為契機，在佛祖三寶尊的御寶前立下誓願，加速建設寂光土，為廣布更加邁進。